Czy istnienie program lub aplikacja do której wrzuci się plik pdf i xml zaświadczenia z ZUS i będzie tam jakieś połączenie pomiędzy tymi dwoma plikami tzn. będzie wynikało z weryfikacji, że ten pdf jest podpisany dokładnie tym xml. Jak na razie to wszystkie aplikacje weryfikują mi tylko xml ,że jest prawidłowy lub nie ale z tego nie wynika, że jest w jakiś sposób powiązany dokładnie z tym pdf.

Nie wiem po co kombinować. Jeśli masz wątpliwości czy zaświadczenie zostało wystawione możesz je sprawdzić na stronie ZUS: https://www.zus.pl/firmy/rozliczenia-z-zus/zaswiadczenie-o-niezaleganiu/weryfikacja-zaswiadczen. Wykonawca przesłał to co dostał.