Czy zamawiający badając podmiotowe środki dowodowe może zastosować art. 128 ust. 5 ustawy Pzp (zwrócić się bezpośrednio do podmiotu, który jest w posiadaniu informacji lub dokumentów istotnych w tym zakresie dla oceny spełniania przez wykonawcę warunków udziału w postępowaniu), bez wcześniejszego skorzystania z art. 128 ust. 1 lub 3 (wezwanie wykonawcy o uzupełnienie/wyjaśnienie podmiotowych środków dowodowych)?

Możesz to robić poza tematem gdyż nie ma spójności w tych zapisach. Skoro jestes przekonany, że nie była to omyłka wykonawcy to badaj - zależy od Ciebie. Oba art. stanowią odmienny tryb postępowania i dotyczą rozbieżnych tematów.