wykonawca oświadczył w formularzu oferty, że jest małym przedsiębiorcą, natomiast w JEDZ oświadczył, że nie jest ani małym ani średnim przedsiębiorcą, czy w takiej sytuacji należy wezwać wykonawcę do złożenia wyjaśnień i czy złożone wyjaśnienia wystarczą?

Ta informacja jest potrzebna tylko i wyłącznie do celów statystycznych - podajemy podczas wypełniania ogłoszenia o udzieleniu zamówienia. Jeżeli z treści oferty wiemy, że jest małym przedsiębiorcą to tak zaznaczymy w ogłoszeniu.
Poza tym, do momentu zmiany ustawy, nie mamy podstaw, żeby taką informację weryfikować czy wzywać do uzupełnienia/wyjaśnienia. Ale :) jeżeli zapowiadane zmiany do nowej ustawy wejdą to może nam dojść kolejny, jak dla mnie dziwaczny, obowiązek.
Wobec powyższego, nic nie robimy.