Bardzo proszę o pomoc i podpowiedź w następujących kwestiach:
Czy oferta złożona elektronicznie w przetargu powyżej progów unijnych i jej załączniki (np. oświadczenie o RODO, warunki gwarancji itp) powinny być podpisane odrębnie ? Czy JEDZ, który według mojej wiedzy powinien być opatrzony odrębnym podpisem elektronicznym Wykonawcy oraz oryginalny dokument elektroniczny gwarancji wadialnej z podpisem gwaranta powinny zostać zeskanowane z ofertą i pozostałymi jej załącznikami i jeszcze raz podpisane ?

W opisanym przypadku nie ma jeszcze praktyki :) stąd możesz spotkać się z różnymi zdaniami.
Prawidłowe będzie np. podpisanie każdego dokumentu, spakowanie, zaszyfrowanie i przed wysłaniem przez ePUAP można jeszcze raz podpisać, ale nie jest to wymagane.